我购买一楼铺面,二,三楼不属于我的房产,土地证是按单层面积的三分之一办理,若以后该楼重建,应如何新建

呵呵,你想的问题还是太远了。你的土地证上所记载的土地使用权面积是经过分担的,如果重建之类,当然是给与跟你土地面积相当的补偿或相当的置换,你操心这个问题没有什么实际价值。