父母要把自己的一套房子过户给儿子,房子在上海,但是儿子在南京工作,如果过户到他儿子名下,那么他儿子再在南京买房,算二套房吗?

应该算,但是异地房产征信系统并未联网,查不到的。你买就是了。或者先买后转。

算,房管局能查到,不如把上海的房子卖了吧,这样再从南京买房,就是一套房,且现在卖,不会有太大损失,一旦政策严了,二手房就会少收入不少。