两个人共同购房，房产证上可以写两个人的名字吗？

其实完全可以办理婚前财产公证就行。你说得比较矛盾：“在房产商那里是一次性付清款，男方在单位办理了住房公积金贷款”是矛盾的，如果是全款一次付清就可以办理共有产权证，产权证可以分为“共同共有”和“按分共有”2种，前者是不分共有比例，后者失去分共有比例的。