因商品房面积不准多交的契税能否退回来合理吗

当然不合理。3%是说在出售房屋时较房屋修完后房产局实际测量允许有3%的误差。因为房屋售出时的面积是在图纸上测量的，而房产证上的是房子修完后实际实地测量的，这样的误差当然是允许的。但这3%的误差是不能作为不退钱给你的理由的，少了就要补给你。这是你得权利，要去找他退回来，还有契税什么的一起退。他想跑都跑不掉。